Öğr. Gör. Dr. Recep ÇOLAK | AVESİS

Akademik Veri Yönetim Sistemi

Yayınlar & Eserler

Makaleler 19

1. Solving the Traveling Salesman Problem with Greedy Genetic Algorithm

Journal of Multidisciplinary Developments. , cilt.9, sa.1, ss.9-18, 2024 (Hakemli Dergi)

2. Hyperparameter Optimized Rapid Prediction of Sea Bass Shelf Life with Machine Learning

Gürfidan R., GENÇ İ. Y., ARMAĞAN H., ÇOLAK R.

Food Analytical Methods , cilt.17, sa.7, ss.1134-1148, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

3. Evrişimli Sinir Ağı Kullanarak El yazısı Rakamların Tanımasında Hiper Parametre Analizi

YİĞİT T., ATMACA Ş., GÜRFİDAN R., ÇOLAK R.

Gazi Mühendislik Bilimleri Dergisi , cilt.9, sa.4, ss.268-277, 2023 (TRDizin)

Creative Commons License

4. Performing Performance Analysis by Implementing Random Forest Algorithm on FPGA Random Forest Algoritmasının FPGA Üzerinde Gerçekleştirilerek Performans Analizinin Yapılması

KUMRAL C. D., TOPAL A., ERSOY M., ÇOLAK R., YİĞİT T.

El-Cezeri Journal of Science and Engineering , cilt.9, sa.4, ss.1315-1327, 2022 (Scopus)

Creative Commons License

Sürdürülebilir Kalkınma

5. Development of a server-based integrated virtual laboratory for digital electronics

ERSOY M., KUMRAL C. D., ÇOLAK R., ARMAĞAN H., YİĞİT T.

Computer Applications in Engineering Education , cilt.30, sa.5, ss.1307-1320, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

6. Üniversite Ders Çizelgeleme Probleminin Genetik Algoritma ile Optimizasyonu

ÇOLAK R., YİĞİT T.

Düzce Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi , cilt.9, 2021 (TRDizin)

7. A qualitative study of large-scale recommendation algorithms for biomedical knowledge bases

Noei E., Hayat T., Perrie J., ÇOLAK R., Hao Y., Vembu S., et al.

International Journal on Digital Libraries , cilt.22, sa.2, ss.197-215, 2021 (ESCI, Scopus)

8. A new method for routing in home health care services

ÇOLAK R., IŞIK A. H., YİĞİT T.

BRAIN-BROAD RESEARCH IN ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND NEUROSCIENCE , cilt.40, 2020 (Scopus)

9. ELASPIC web-server: Proteome-wide structure-based prediction of mutation effects on protein stability and binding affinity

Witvliet D. K., Strokach A., Giraldo-Forero A. F., Teyra J., ÇOLAK R., Kim P. M.

Bioinformatics , cilt.32, sa.10, ss.1589-1591, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

10. JBASE: Joint Bayesian Analysis of Subphenotypes and Epistasis

ÇOLAK R., Kim T., Kazan H., Oh Y., Cruz M., Valladares-Salgado A., et al.

Bioinformatics , cilt.32, sa.2, ss.203-210, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

11. Semi-supervised Learning Predicts Approximately One Third of the Alternative Splicing Isoforms as Functional Proteins

Hao Y., ÇOLAK R., Teyra J., Corbi-Verge C., Ignatchenko A., Hahne H., et al.

Cell Reports , cilt.12, sa.2, ss.183-189, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)

12. Combining structural modeling with ensemble machine learning to accurately predict protein fold stability and binding affinity effects upon mutation

Berliner N., Teyra J., ÇOLAK R., Lopez S. G., Kim P. M.

PLoS ONE , cilt.9, sa.9, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)

13. Distinct Types of Disorder in the Human Proteome: Functional Implications for Alternative Splicing

ÇOLAK R., Kim T., Michaut M., Sun M., Irimia M., Bellay J., et al.

PLoS Computational Biology , cilt.9, sa.4, 2013 (SCI-Expanded, Scopus) Sürdürülebilir Kalkınma

Sürdürülebilir Kalkınma

14. The evolutionary landscape of alternative splicing in vertebrate species

Barbosa-Morais N. L., Irimia M., Pan Q., Xiong H. Y., Gueroussov S., Lee L. J., et al.

Science , cilt.338, sa.6114, ss.1587-1593, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

15. Tissue-Specific Alternative Splicing Remodels Protein-Protein Interaction Networks

Ellis J. D., Barrios-Rodiles M., ÇOLAK R., Irimia M., Kim T., Calarco J. A., et al.

Molecular Cell , cilt.46, sa.6, ss.884-892, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

16. An omics perspective of protein disorder

Bellay J., Michaut M., Kim T., Han S., ÇOLAK R., Myers C. L., et al.

Molecular BioSystems , cilt.8, sa.1, ss.185-193, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

17. Module discovery by exhaustive search for densely connected, co-expressed regions in biomolecular interaction networks

ÇOLAK R., Moser F., Chu J. S., Schönhuth A., Chen N., Ester M.

PLoS ONE , cilt.5, sa.10, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)

18. PATIKAmad: Putting microarray data into pathway context

Babur O., ÇOLAK R., Demir E., Dogrusoz U.

Proteomics , cilt.8, sa.11, ss.2196-2198, 2008 (SCI-Expanded, Scopus)

19. PATIKAweb: A Web interface for analyzing biological pathways through advanced querying and visualization

Dogrusoz U., Erson E., Giral E., Demir E., Babur O., Cetintas A., et al.

Bioinformatics , cilt.22, sa.3, ss.374-375, 2006 (SCI-Expanded, Scopus)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler 10

1. Hyper Parameter Analysis in Recognition of Handwritten Digits Using Convolutional Neural Network

YİĞİT T., ATMACA Ş., GÜRFİDAN R., ÇOLAK R.

International Conference on Artifical Intelligence and Applied Mathematics in Engineering ICAIAME 2023, Antalya, Türkiye, 3 - 05 Kasım 2023, cilt.1, ss.90, (Özet Bildiri)

2. The effect of genetic algorithm parameters in the solution of the course timetable problem Ders Çizelgeleme Probleminin Çözümüne Genetik Algoritma Parametrelerinin Etkisi

ÇOLAK R., YİĞİT T.

2nd International Conference on Computer Science and Engineering, UBMK 2017, Antalya, Türkiye, 5 - 08 Ekim 2017, ss.1090-1094, (Tam Metin Bildiri)

3. Development of A Software to Determine the Shelf Life of Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss) Under Different Temperatures

GENÇ İ. Y., ÇOLAK R., YİĞİT T., DİLER A.

3rd INTERNATIONAL CONFERENCE ON ENGINEERING AND NATURAL SCIENCES, 3 - 07 Mayıs 2017, (Özet Bildiri)

4. Uzaktan Eğitimde Yeni Bir Yaklaşım: e-stüdyo

YİĞİT T., BİNGÖL O., ARMAĞAN H., ARUĞASLAN E., ÇOLAK R., YAKUT G., et al.

Akademik Bilişim 2010, Muğla, Türkiye, 10 - 12 Şubat 2010, cilt.1, ss.97-103, (Tam Metin Bildiri)

5. Öğrenci ve Öğretim Elemanının Uzaktan Eğitime Bakış Açısı

YİĞİT T., BİNGÖL O., ARMAĞAN H., ÇOLAK R., ARUĞASLAN E., YAKUT G., et al.

Akademik Bilişim 2010, Muğla, Türkiye, 10 - 12 Şubat 2010, cilt.1, ss.27-32, (Tam Metin Bildiri)

6. Inferring cancer subnetwork markers using density-constrained biclustering

Dao P., ÇOLAK R., Salari R., Moser F., Davicioni E., Schönhuth A., et al.

19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Joint with the 10th European Conference on Computational Biology, ISMB/ECCB 2011, Vienna, Avusturya, 17 - 19 Temmuz 2011, cilt.27, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

Sürdürülebilir Kalkınma

7. E-Stüdyo Teknik Altyapısı ve Uzaktan Eğitime Katkısı

YİĞİT T., BİNGÖL O., ALBAYRAK M., ARMAĞAN H., ARUĞASLAN E., ÇOLAK R., et al.

IODL & ICEM 2010 International Joint Conference and Media Days, Eskişehir, Türkiye, 6 - 08 Ekim 2010, ss.933-942, (Tam Metin Bildiri)

8. Mining cohesive patterns from graphs with feature vectors

Moser F., ÇOLAK R., Rafiey A., Ester M.

9th SIAM International Conference on Data Mining 2009, SDM 2009, Sparks, NV, Amerika Birleşik Devletleri, 30 Nisan - 02 Mayıs 2009, cilt.2, ss.589-600, (Tam Metin Bildiri)

9. Dense graphlet statistics of protein interaction and random networks

ÇOLAK R., Hormozdiari F., Moser F., Schönhuth A., Holman J., Ester M., et al.

14th Pacific Symposium on Biocomputing, PSB 2009, Kohala Coast, HI, Amerika Birleşik Devletleri, 5 - 09 Ocak 2009, ss.178-189, (Tam Metin Bildiri)

10. Exploratory analysis of co-change graphs for code refactoring

Khosravi H., ÇOLAK R.

22nd Canadian Conference on Artificial Intelligence, Canadian AI 2009, Kelowna, Kanada, 25 - 27 Mayıs 2009, cilt.5549 LNAI, ss.219-223, (Tam Metin Bildiri)

Kitaplar 1

1. Veri Madenciliği ve Uygulamaları

ERSOY M., ÇOLAK R.

Yapay Zeka Kuramdan Uygulamaya, ÇAKIR HÜSEYİN, ULUYOL ÇELEBİ, Editör, Nobel, Ankara, ss.331-352, 2022

Metrikler

Yayın

30

Yayın (WoS)

14

Yayın (Scopus)

21

Atıf (Scopus)

1578

H-İndeks (Scopus)

11

Atıf (TrDizin)

6

H-İndeks (TrDizin)

2

Atıf (Diğer Toplam)

12

Proje

2

Açık Erişim

2

BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları